#14 Реагенты NEB для нанопорового секвенирования

Все, кто знаком с технологией нанопорового секвенирования, знают, что для пробоподготовки используются реагенты компании New England Biolabs. В данном обзоре мы собрали для вас все наборы и реактивы от NEB, которые отлично подойдут для успешного эксперимента по нанопоровому секвенированию.

Наборы Monarch для выделения длинных фрагментов высококачественной ДНК

Набор Monarch® для выделения геномной ДНК

Набор "Monarch Genomic DNA Kit" предназначен для выделения гДНК из широкого спектра биологических образцов: тканей, клеток, крови, грамположительных и грамотрицательных бактерий, дрожжей, слюны и буккального эпителия.

• Набор позволяет выделять фрагменты длиной 50 - 70 кб;
• Чистота и качество выделенной ДНК на высоте;
• Набор валидирован на выделения из очень широкого спектра биологических образцов.

Подробный обзор набора

Наборы для выделения высокомолекулярной ДНК "Monarch® HMW DNA Extraction Kit"

В наборах "Monarch® HMW DNA Extraction Kit" реализована новая, запатентованная технология использования крупных, гладких стеклянных бусин для преципитации высокомолекулярной ДНК. Методика обеспечивает высокий выход длинных ДНК фрагментов отличного качества и чистоты, не требующие дополнительной подготовки перед дальнейшим использованием, например для секвенирования длинных прочтений.

• Наборы предназначены для выделения высокомолекулярной ДНК из клеток, крови и тканей;
• Быстрый и простой протокол позволит подготовить и секвенировать образец в один день;
• Есть возможность слегка видоизменять протокол для получения фрагментов необходимой длины.

Подробный обзор наборов

Модуль "NEBNext Companion Module" для пробоподготовки библиотек

Теперь доступен модуль для протокола Ligation, в состав которого уже входят все необходимые компоненты, аналогично SQK-LSK109 and SQK-LSK110.

• Объемы реагентов рассчитаны на протоколы SQK-LSK109 и SQK-LSK110;
• Модуль совместим со всеми приборами ONT: MinION®, GridION®, PromethION™;
• Больше никаких отходов - нет лишним буферам и остаткам реагентов.

Модуль NEBNext® ARTIC SARS-CoV-2 для приготовления пулов ампликонов к полногеномному секвенированию вируса SARS-CoV-2 на платформе ONT

Оптимизированный, высокоэффективный протокол;

• Широкий диапазон исходного количества вирусного генома (10-10 000 копий);
• Сбалансированные пулы праймеров для увеличения глубины и однородности покрытия генома SARS-CoV-2;
• Размер фрагментов в библиотеке ~400 п.н.;
• Включает магнитные шарики для очистки образца NEBNext (SPRIselect®).

Набор для петлевой изотермической WarmStart® амплификации ДНК и РНК для протокола LAMPore

Набор предназначен для быстрой подготовки при комнатной температуре реакционной смеси для проведения петлевой изотермической амплификации ДНК (LAMP) или РНК (RT-LAMP).

• Простой одноэтапный протокол для LAMP и RT-LAMP;
• Совместим с методами детекции множественных мишеней;
• Технология WarmStart подавляет активность фермента при комнатной температуре, повышая специфичность реакции. 

Подробный обзор LAMP

Другие реагенты для нанопорового секвенирования

• Модуль NEBNext® Ultra™ II для восстановления концов ДНК и безматричного 3'-аденилирования
• Модуль NEBNext® Ultra™ II для лигирования
• Готовая смесь для ПЦР с Q5® Hot Start HF ДНК-полимеразой
• LongAmp® Taq ДНК-полимераза
• T4 ДНК-лигаза
• Модуль NEBNext® для быстрого лигирования
• Готовая смесь для лигирования субстратов с тупыми/липкими концами
• Смесь ферментов NEBNext® для восстановления ДНК из фиксированных тканей
• Набор LunaScript® SuperMix для обратной транскрипции