Реактивы, оборудование и
расходные материалы
для лабораторий
English version
пн-пт: 9:30-18:00 по МСК
0

Нанопоровый секвенатор PromethION

PromethION – самый высокопроизводительный нанопоровый секвенатор производства Oxford Nanopore Technologies и самый высокопроизводительный секвенатор в мире!

Брошюра ↓

Главные преимущества PromethION

Нанопоровые секвенаторы PromethION 48 и PromethION 24
  • Относится к 3-му поколению NGS-секвенаторов,
  • Максимальная производительность - до 9,6 трлн. нуклеотидов (до 4,8 трлн. нуклеотидов – в случае PromethION 24, до 200 млрд. нуклеотидов с одной ячейки),
  • Одновременный и независимый процессинг от 1 до 48 (модель PormethION 48) или до 24 (модель PromethION 24) проточных ячеек,
  • Очень низкая стоимость прочтения одного нуклеотида,
  • Простая и быстрая пробоподготовка без амплификации,
  • Длинные прочтения без ограничения по длине,
  • Возможность отслеживать параметры, контролировать процесс секвенирования и проводить бейсколлинг в реальном времени,
  • Прибор поставляется со станцией для сбора, обработки и хранения данных,
  • Программное обеспечение для первичной и вторичной обработки данных установлено в приборе,
  • Прибор обрабатывает данные в десятки раз быстрее, чем станционарный компьютер или ноутбук,
  • Возможность остановки запуска в любой момент времени.

Запросить цену→

Видеообзор нанопорового секвенатора PromethION

Технология нанопорового секвенирования

Ключевым компонентом (и основным расходным материалом) нанопровых секвенаторов является проточная ячейка. На рисунке ниже показаны проточные ячейки, установленные в секвенирующий модуль PromethION 48.

Проточные ячейки, установленные в нанопоровый секвенатор PromethION 48

Процесс секвенирования происходит в камере ячейки, содержащей непроводящую мембрану, в которую встроены проводящие белковые нанопоры. Обе стороны мембраны омывают растворы электролитов.

Во время пробоподготовки к концам фрагментов нуклеиновых кислот пришиваются специальные моторные белки. При попадании образца в камеру проточной ячейки эти белки связываются с нанопорами.

При запуске прибора между сторонами мембраны возникает разность потенциалов. Под действием электрического поля и при участии молекул АТФ моторные белки расплетают двухцепочечную нуклеиновую кислоту и направляют одну из цепей в нанопору. (При этом вторая цепь может присоединиться к соседней поре либо остаться в растворе.)

Принцип нанопорового секвенирование

Дальнейшее движение фрагмента нуклеиновой кислоты через канал осуществляется за счет его отрицательного заряда. Одновременно с исследуемой молекулой под напряжением через нанопоры движутся ионы, содержащиеся в растворах электролитов. Поскольку размер нуклеотидов неодинаков, величина ионного тока зависит от последовательности участка нуклеиновой кислоты, проходящего через канал в данный момент времени. В ходе секвенирования происходит регистрация этого тока.

Принцип нанопорового секвенирование

Таким образом, первичные данные нанопорового секвенирования представляют собой совокупность скачков силы тока ионов.

Первичные данные нанопопрового секвенирования

После секвенирования одного фрагмента нанопора остается активной и может аналогично пропустить через себя множество других цепей нуклеиновых кислот.

Бейсколлинг – распознавание нуклеотидов по исходному сигналу – осуществляет специальное программное обеспечение.

Видеообзор принципа нанопопрового секвенирования

Характеристики секвенаторов PromethION

Характеристика Значение
PromethION 48 PromethION 24
Секвенирующий модуль
Тип совместимых проточных ячеек Проточные ячейки PromethION R9.4
Количество одновременно процессируемых проточных ячеек от 1 до 48 шт. от 1 до 24 шт.
Производительность до 9,6 трлн. н. до 4,8 трлн. н.
Количество раздельных блоков для проточных ячеек 6 3
Количество ячеек в одном секвенирующем блоке от 1 до 8 шт.
Габариты (Ш х В х Г, см) 59 х 19 х 43
Вес 25 кг
Станция для сбора, хранения и обработки данных
SSD-диск 64 Тб 32 Тб
Оперативная память 384 Гб
Предустановленное ПО ОС Linux, ОС PromethION, MinKNOW, Guppy, EPI2ME
Процессор Intel CPU, 4 x NVIDIA GV100 Intel CPU, 2 x NVIDIA GV100
Габариты (Ш х В х Г, см) 17,8 х 44 х 47
Вес 25 кг

Стартовая комплектация прибора

Ниже представлена стартовая комплектация секвенаторов PromethION. Для подготовки библиотек также необходимо приобрести приобрести комплект ферментов и реагентов. Состав комплекта зависит от типа исследуемых образов (ДНК, РНК, кДНК, ампликоны и др.) и выбранного протокола работы.

Компонент Артикул Количество
PromethION 48 PromethION 24
Секвенирующий модуль PRM48CapEx или
PRM24CapEx
1 шт.
Станция для сбора, хранения и обработки данных 1 шт.
Набор кабелей 1 шт.
Проточная ячейка R9.4.1 FLO-PRO002
120 шт. 60 шт.
Набор для подготовки библиотек SQK-LSK109
24 шт. 14 шт.
Набор с контрольной ДНК EXP-CTL001 1 шт.
Лицензия на использование ПО - 3 года

Запросить цену→

Области применения PromethION

  • Полногеномное секвенирование de novo и ресеквенирование,
  • Облегчение сборки данных, полученных на других секвенаторах,
  • Детекция хромосомных аберраций,
  • Исследование альтернативного сплайсинга,
  • Определение копийности определенных последовательностей,
  • Анализ экспрессии генов,
  • Углубленное исследование образцов бактериального метагенома (с предварительной амплификацией полного гена 16S рРНК),
  • Детекция модифицированных нуклеотидов,
  • Анализ профиля метилирования и др.

Другие секвенаторы Oxford Nanopore Technologies


С этим товаром покупают

Артикул Название товара Цена*
SQK-16S024 Набор реагентов для анализа бактериального метагенома 16S Barcoding Kit 1-24 по запросу
SQK-DCS109 Набор для подготовки библиотек кДНК Direct cDNA Sequencing Kit (6 реакций) по запросу
SQK-PCS109 Набор реагентов для синтеза кДНК PCR-cDNA Sequencing Kit (6 реакций) по запросу
EXP-WSH002 Набор реагентов для промывки проточной ячейки (12 реакций) по запросу
SQK-LSK109 Набор для подготовки библиотек ДНК Ligation Sequencing kit 1D (6 реакций) по запросу
EXP-NBD104 Набор для PCR-free мультиплексирования Native Barcoding Kit 1D (6 реакций) по запросу
EXP-NBD114 Набор для PCR-free мультиплексирования Native Barcoding Kit 1D 13-24 (6 реакций) по запросу
EXP-PBC096 Набор для мультиплексирования PCR Barcoding Kit 96 (R9) (10 реакций) по запросу
SQK-RBK004 Набор для быстрого мультиплексирования Rapid Barcoding Sequencing Kit (12x) (6 реакций) по запросу
T3010 L Набор Monarch® для выделения геномной ДНК (150 выделений) 45 714 руб.
531.83
E7180 S Модуль NEBNext® для подготовки библиотек Oxford Nanopore Technologies® (24 реакции) 106 473 руб.
1 238.69
*Все цены указаны с учетом НДС. Стоимость доставки рассчитывается отдельно.

кнопка подписки.jpg

Вебинары

Подробнее о вебинаре
Вебинар "Варианты подготовки NGS-библиотек" 13 августа!

Акции

Акция на реагенты AJ.jpg
Акция: скидка 15% на реагенты Analytik Jena со склада!

Aкция SkyGen
Акция: бонус при покупке экспресс-тестов для диагностики COVID-19!

Новости

Перейти к новости
Новые решения в портфолио 10x Genomics!

Новый набор NEB
Новый набор для детекции коронавируса SARS-CoV-2 от New England Biolabs

биомолтекст.jpg
SkyGen - спонсор "Био/мол/текст"-2020/2021!

Реагенты для диагностики COVID-19 в портфеле SkyGen
Реагенты для диагностики COVID-19 в портфеле SkyGen!

Свежие обзоры

выделение НК.jpg
Очистка нуклеиновых кислот: многообразие методов и подходов

#18 Реагенты для диагностики COVID-19 в портфолио SkyGen
Реагенты для диагностики COVID-19 в портфолио SkyGen

Обогащение длинных фрагментов генома с помощью нуклеазы Cas9 от Oxford Nanopore Technologies Новый метод обогащения длинных фрагментов генома с помощью нуклеазы Cas9 от Oxford Nanopore Technologies

Петлевая изотермическая амплификация ДНК и РНК Петлевая изотермическая амплификация ДНК и РНК (LAMP и RT-LAMP): решения New England Biolabs

Автоматизация-шаг в будущее.jpg Автоматизация лаборатории – шаг в будущее. Индивидуальный подход от компании Analytik Jena

62 Новое решение Visium от 10x Genomics для анализа пространственной экспрессии генов
Новое решение Visium от 10x Genomics для анализа пространственной экспрессии генов

Мы в соцсетях

© 2012-2020 SkyGen
Информация и цены на сайте не являются публичной офертой