Реактивы, оборудование и
расходные материалы
для лабораторий
8 (800) 333-12-26 info@skygen.com
пн-пт: 9:30-18:00 по МСК

Нанопоровый секвенатор PromethION 24/48

PromethION – самый высокопроизводительный нанопоровый секвенатор производства Oxford Nanopore Technologies и самый высокопроизводительный секвенатор в мире!

Брошюра ↓

Главные преимущества PromethION

Нанопоровые секвенаторы PromethION 48 и PromethION 24
  • Относится к 3-му поколению NGS-секвенаторов,
  • Максимальная производительность - до 9,6 трлн. нуклеотидов (до 4,8 трлн. нуклеотидов – в случае PromethION 24, до 200 млрд. нуклеотидов с одной ячейки),
  • Одновременный и независимый процессинг от 1 до 48 (модель PormethION 48) или до 24 (модель PromethION 24) проточных ячеек,
  • Очень низкая стоимость прочтения одного нуклеотида,
  • Простая и быстрая пробоподготовка без амплификации,
  • Длинные прочтения без ограничения по длине,
  • Возможность отслеживать параметры, контролировать процесс секвенирования и проводить бейсколлинг в реальном времени,
  • Прибор поставляется со станцией для сбора, обработки и хранения данных,
  • Программное обеспечение для первичной и вторичной обработки данных установлено в приборе,
  • Прибор обрабатывает данные в десятки раз быстрее, чем станционарный компьютер или ноутбук,
  • Возможность остановки запуска в любой момент времени.

Запросить цену→

Видеообзор нанопорового секвенатора PromethION

Технология нанопорового секвенирования

Ключевым компонентом (и основным расходным материалом) нанопровых секвенаторов является проточная ячейка. На рисунке ниже показаны проточные ячейки, установленные в секвенирующий модуль PromethION 48.

Проточные ячейки, установленные в нанопоровый секвенатор PromethION 48

Процесс секвенирования происходит в камере ячейки, содержащей непроводящую мембрану, в которую встроены проводящие белковые нанопоры. Обе стороны мембраны омывают растворы электролитов.

Во время пробоподготовки к концам фрагментов нуклеиновых кислот пришиваются специальные моторные белки. При попадании образца в камеру проточной ячейки эти белки связываются с нанопорами.

При запуске прибора между сторонами мембраны возникает разность потенциалов. Под действием электрического поля и при участии молекул АТФ моторные белки расплетают двухцепочечную нуклеиновую кислоту и направляют одну из цепей в нанопору. (При этом вторая цепь может присоединиться к соседней поре либо остаться в растворе.)

Принцип нанопорового секвенирование

Дальнейшее движение фрагмента нуклеиновой кислоты через канал осуществляется за счет его отрицательного заряда. Одновременно с исследуемой молекулой под напряжением через нанопоры движутся ионы, содержащиеся в растворах электролитов. Поскольку размер нуклеотидов неодинаков, величина ионного тока зависит от последовательности участка нуклеиновой кислоты, проходящего через канал в данный момент времени. В ходе секвенирования происходит регистрация этого тока.

Принцип нанопорового секвенирование

Таким образом, первичные данные нанопорового секвенирования представляют собой совокупность скачков силы тока ионов.

Первичные данные нанопопрового секвенирования

После секвенирования одного фрагмента нанопора остается активной и может аналогично пропустить через себя множество других цепей нуклеиновых кислот.

Бейсколлинг – распознавание нуклеотидов по исходному сигналу – осуществляет специальное программное обеспечение.

Видеообзор принципа нанопопрового секвенирования

Характеристики секвенаторов PromethION

Характеристика Значение
PromethION 48 PromethION 24
Секвенирующий модуль
Тип совместимых проточных ячеек Проточные ячейки PromethION
Количество одновременно процессируемых проточных ячеек от 1 до 48 шт. от 1 до 24 шт.
Производительность до 9,6 трлн. н. до 4,8 трлн. н.
Количество раздельных блоков для проточных ячеек 6 3
Количество ячеек в одном секвенирующем блоке от 1 до 8 шт.
Габариты (Ш х В х Г, см) 59 х 19 х 43
Вес 25 кг
Станция для сбора, хранения и обработки данных
SSD-диск 64 Тб 32 Тб
Оперативная память 384 Гб
Предустановленное ПО ОС Linux, ОС PromethION, MinKNOW, Guppy, EPI2ME
Процессор Intel CPU, 4 x NVIDIA GV100 Intel CPU, 2 x NVIDIA GV100
Габариты (Ш х В х Г, см) 17,8 х 44 х 47
Вес 25 кг

Стартовая комплектация прибора

Ниже представлена стартовая комплектация секвенаторов PromethION. Для подготовки библиотек также необходимо приобрести приобрести комплект ферментов и реагентов. Состав комплекта зависит от типа исследуемых образов (ДНК, РНК, кДНК, ампликоны и др.) и выбранного протокола работы.

Компонент Артикул Количество
PromethION 48 PromethION 24
Секвенирующий модуль PRM48CapEx или
PRM24CapEx
1 шт.
Станция для сбора, хранения и обработки данных 1 шт.
Набор кабелей 1 шт.
Проточная ячейка FLO-PRO002 / FLO-PRO114M
120 шт. 60 шт.
Набор для подготовки библиотек SQK-LSK109
SQK-LSK114
24 шт. 14 шт.
Набор с контрольной ДНК EXP-CTL001 1 шт.
Лицензия на использование ПО - 3 года

Запросить цену→

Области применения PromethION

  • Полногеномное секвенирование de novo и ресеквенирование,
  • Облегчение сборки данных, полученных на других секвенаторах,
  • Детекция хромосомных аберраций,
  • Исследование альтернативного сплайсинга,
  • Определение копийности определенных последовательностей,
  • Анализ экспрессии генов,
  • Углубленное исследование образцов бактериального метагенома (с предварительной амплификацией полного гена 16S рРНК),
  • Детекция модифицированных нуклеотидов,
  • Анализ профиля метилирования и др.

Другие секвенаторы Oxford Nanopore Technologies


С этим товаром покупают

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.