Реактивы, оборудование и
расходные материалы
для лабораторий
English version
пн-пт: 9:30-18:00 по МСК
0

Нанопоровый секвенатор PromethION

Oxford Nanopore Technologies
Артикул Название товара Цена*
PRM48CapEx Нанопоровый секвенатор PromethION 48 по запросу
PRM24CapEx Нанопоровый секвенатор PromethION 24 по запросу
*Все цены указаны с учетом НДС. Стоимость доставки рассчитывается отдельно.

PromethION – самый высокопроизводительный нанопоровый секвенатор производства Oxford Nanopore Technologies и самый высокопроизводительный секвенатор в мире!

Нанопоровые секвенаторы PromethION 48 и PromethION 24

Модель PromethION 48 позволяет одновременно и независимо друг от друга процессировать от 1 до 48 проточных ячеек R9. В рамках одного запуска на разных ячейках можно секвенировать образцы, подготовленные по разным протоколам. PromethION 24 - модель , рассчитанная на работу с 24 проточными ячейками R9.

Оба прибора состоят из секвенирующего модуля и станции для сбора, обработки и хранения данных.

Главные преимущества PromethION

  • Относится к 3-му поколению NGS-секвенаторов,
  • Простая и быстрая пробоподготовка без амплификации,
  • Длинные прочтения без ограничения по длине,
  • Максимальная производительность - до 9,6 трлн. нуклеотидов (до 4,8 трлн. нуклеотидов – в случае PromethION, до 200 млрд. нуклеотидов с одной ячейки),
  • Очень низкая стоимость прочтения одного нуклеотида,
  • Возможность отслеживать параметры, контролировать процесс секвенирования и проводить бейсколлинг в реальном времени,
  • Для работы не требуется внешней управляющей станции,
  • Программное обеспечение для первичной и вторичной обработки данных установлено в приборе,
  • Прибор обрабатывает данные в десятки раз быстрее, чем станционарный компьютер или ноутбук,
  • Возможность остановки запуска в любой момент времени.

Области применения PromethION

  • Полногеномное секвенирование de novo и ресеквенирование,
  • Облегчение сборки данных, полученных на других секвенаторах,
  • Детекция хромосомных аббераций,
  • Исследование альтернативного сплайсинга,
  • Определение копийности определенных последовательностей,
  • Анализ экспрессии генов,
  • Углубленное исследование образцов бактериального метагенома (с предварительной амплификацией полного гена 16S рРНК),
  • Детекция модифицированных нуклеотидов,
  • Анализ профиля метилирования и др.

Характеристики секвенаторов PromethION

Характеристика Значение
PromethION 48 PromethION 24
Секвенирующий модуль
Тип совместимых проточных ячеек Проточные ячейки PromethION R9.4
Количество одновременно процессируемых проточных ячеек от 1 до 48 шт. от 1 до 24 шт.
Производительность до 9,6 трлн. н. до 4,8 трлн. н.
Количество раздельных блоков для проточных ячеек 6 3
Количество ячеек в одном секвенирующем блоке от 1 до 8 шт.
Габариты (Ш х В х Г, см) 59 х 19 х 43
Вес 25 кг
Станция для сбора, хранения и обработки данных
SSD-диск 64 Тб 32 Тб
Оперативная память 384 Гб
Предустановленное ПО ОС Linux, ОС PromethION, MinKNOW, Guppy, EPI2ME
Процессор Intel CPU, 4 x NVIDIA GV100 Intel CPU, 2 x NVIDIA GV100
Габариты (Ш х В х Г, см) 17,8 х 44 х 47
Вес 25 кг

Технология нанопорового секвенирования

Ключевым компонентом (и основным расходным материалом) нанопровых секвенаторов является проточная ячейка. На рисунке ниже показаны проточные ячейки, установленные в секвенирующий модуль PromethION 48.

Проточные ячейки, установленные в нанопоровый секвенатор PromethION 48

Процесс секвенирования происходит в камере ячейки, содержащей непроводящую мембрану, в которую встроены проводящие белковые нанопоры. Обе стороны мембраны омывают растворы электролитов.

Во время пробоподготовки к концам фрагментов нуклеиновых кислот пришиваются специальные моторные белки. При попадании образца в камеру проточной ячейки эти белки связываются с нанопорами.

При запуске прибора между сторонами мембраны возникает разность потенциалов. Под действием электрического поля и при участии молекул АТФ моторные белки расплетают двухцепочечную нуклеиновую кислоту и направляют одну из цепей в нанопору. (При этом вторая цепь может присоединиться к соседней поре либо остаться в растворе.)

Принцип нанопорового секвенирование

Дальнейшее движение фрагмента нуклеиновой кислоты через канал осуществляется за счет его отрицательного заряда. Одновременно с исследуемой молекулой под напряжением через нанопоры движутся ионы, содержащиеся в растворах электролитов. Поскольку размер нуклеотидов неодинаков, величина ионного тока зависит от последовательности участка нуклеиновой кислоты, проходящего через канал в данный момент времени. В ходе секвенирования происходит регистрация этого тока.

Принцип нанопорового секвенирование

Таким образом, первичные данные нанопорового секвенирования представляют собой совокупность скачков силы тока ионов.

Первичные данные нанопопрового секвенирования

После секвенирования одного фрагмента нанопора остается активной и может аналогично пропустить через себя множество других цепей нуклеиновых кислот.

Бейсколлинг – распознавание нуклеотидов по исходному сигналу – осуществляет специальное программное обеспечение.

Видеообзор принципа нанопопрового секвенирования

Стартовая комплектация прибора

Компонент Артикул Количество
PromethION 48 PromethION 24
Секвенирующий модуль PRM48CapEx или
PRM24CapEx
1 шт.
Станция для сбора, хранения и обработки данных 1 шт.
Набор кабелей 1 шт.
Проточная ячейка R9.4.1 FLO-PRO002
120 шт. 60 шт.
Набор для подготовки библиотек SQK-LSK109
24 шт. 14 шт.
Набор с контрольной ДНК EXP-CTL001 1 шт.
Лицензия на использование ПО - 3 года

Видеообзор нанопорового секвенатора PromethION

С этим товаром покупают

Артикул Название товара Цена*
SQK-DCS109 Набор для подготовки библиотек кДНК Direct cDNA Sequencing Kit (6 реакций) по запросу
SQK-PCS109 Набор реагентов для синтеза кДНК PCR-cDNA Sequencing Kit (6 реакций) по запросу
EXP-WSH002 Набор реагентов для промывки проточной ячейки (12 реакций) по запросу
SQK-LSK109 Набор для подготовки библиотек ДНК Ligation Sequencing kit 1D (6 реакций) по запросу
EXP-NBD104 Набор для PCR-free мультиплексирования Native Barcoding Kit 1D (6 реакций) по запросу
EXP-NBD114 Набор для PCR-free мультиплексирования Native Barcoding Kit 1D 13-24 (6 реакций) по запросу
EXP-PBC096 Набор для мультиплексирования PCR Barcoding Kit 96 (R9) (10 реакций) по запросу
SQK-RBK004 Набор для быстрого мультиплексирования Rapid Barcoding Sequencing Kit (12x) (6 реакций) по запросу
T3010 L Набор Monarch® для выделения геномной ДНК (150 выделений) 37 586 руб.
531.83
E7180 S Модуль NEBNext® для подготовки библиотек Oxford Nanopore Technologies® (24 реакции) 87 542 руб.
1 238.69
*Все цены указаны с учетом НДС. Стоимость доставки рассчитывается отдельно.

Обратная связь

© 2012-2019 SkyGen
Информация и цены на сайте не являются публичной офертой
На нашем веб-сайте мы используем файлы cookie, которые помогают нам создать максимально удобные для посетителя условия пользования сайтом. Если Вы продолжите использовать сайт, мы будем считать что Вас это устраивает.
ОK