Реактивы, оборудование и
расходные материалы
для лабораторий
8 (800) 333-12-26 info@skygen.com
пн-пт: 9:30-18:00 по МСК

Проточные ячейки для PromethION

Проточная ячейка – ключевой компонент и основной расходный материал, необходимый для работы нанопопровых секвенаторов Oxford Nanopore Technologies. Данные проточные ячейки совместимы с секвенаторами PromethION P2 Solo, PromethION24 и PromethION48.

Проточная ячейка PromethION в упаковке

Проточная ячейка FLO-PRO114M (R10.4.1) содержит запатентованную матрицу датчиков, специализированную интегральную схему (ASIC) и нанопоры R10. Нанопоры серии R10 содержат двойную считывающую головку и подходят для экспериментов, где требуется высокая точность консенсуса. В сочетании с химией 14 версии R10.4.1 генерирует данные с модальной точностью выше 99%. 

Проточная ячейка FLO-PRO002 (R9.4.1) содержит запатентованную матрицу датчиков, специализированную интегральную схему (ASIC) и нанопоры R9.4.1.

Совместимость с протоколами

FLO-PRO114M (R10.4.1) Ligation Sequencing Kit V14 (SQK-LSK114)
Ligation Sequencing Kit XL V14 (SQK-LSK114-XL)
Rapid Sequencing Kit V14 (SQK-RAD114)
Rapid Barcoding Kit 24 V14 (SQK-RBK114.24)
Rapid Barcoding Kit 96 V14 (SQK-RBK114.96)
Native Barcoding Kit 24 V14 (SQK-NBD114.24)
Native Barcoding Kit 96 V14 (SQK-NBD114.96)
Ultra-Long Sequencing Kit V14 (SQK-ULK114)
PCR Expansion (EXP-PCA001)
Rapid PCR Barcoding Kit 24 V14 (SQK-RPB114.24)
FLO-PRO002 (R9.4.1) PCR-cDNA Sequencing Kit (SQK-PCS111)
Direct RNA Sequencing Kit (SQK-RNA002)
Rapid Barcoding Kit 96 (SQK-RBK110.96)
Rapid PCR Barcoding Kit (SQK-RPB004)
16S Barcoding Kit 1-24 (SQK-16S024)

Характеристики проточной ячейки PromethION 

Характеристика Значение
Максимальное количество пор 12 000 шт.
Количество электронных каналов контроля пор 3 000 шт.
Среднее количество пор (на момент первого запуска) 6 000 - 9 000 шт.
Производительность (зависит от протокола) до 200 млр.
нуклеотидов
Совместимость с приборами PromethION
Объем наносимой библиотеки 150/200 мкл
Общий срок годности при соблюдении условий хранения (до запуска) 3 месяца
Общее время работы при соблюдении условий хранения и промывки до 64 часов
Температура хранения +4°C

Перед проведением эксперимента необходимо с помощью программного обеспечения провести проверку количества пор на ячейке (Flow Cell QC). Это не требует внесения каких-либо реагентов и не влияет на общий срок годности ячейки.

Количество данных секвенирования, получаемых с помощью одной ячейки, зависит от типа эксперимента, количества рабочих пор в момент запуска, количества библиотеки и длины фрагментов нуклеиновых кислот.

Устройство проточных ячеек

Проточная ячейка для секвенатора PromethION имеет иную конфигурацию в сравнении с ячейками R9 и R10 для MinION/GridION, но состоит из тех же двух основных систем: проточной и детектирующей. В ячейке PromethION эти системы расположены одна над другой. Соответственно, все ручные манипуляции с ячейкой осуществляются в ее верхней части, а сам процесс секвенирования происходит в нижней части.

Проточная ячейка PromethION

Проточная система предназначена для внесения в ячейку буферных растворов для прайминга (промывки ячейки и активации пор) и библиотек, а также удаления отходов.

Основные элементы проточной системы:

  • Порт для прайминга и внесения исследуемых образцов (закрыт крышкой),
  • Два порта для удаления отходов,
  • Отсек для сбора отходов,
  • Клапаны,
  • Камера над сенсорной мембраной с нанопорами.

Детектирующая система представлена двумя основными компонентами: сенсорной матрицей и интегральной микросхемой (ASIC).

Сенсорная матрица, в свою очередь состоит из мембраны с отверстиями, с одной стороны которых закреплены нанопоры, а с другой – платиновые электроды.

Нанопора ячейки представляет собой модифицированную молекулу липопротеина CsgG E.coli, способную пропускать через себя молекулы нуклеиновых кислот. Отверстия мембраны устроены таким образом, чтобы надежно удерживать 9 субъединиц этой белковой структуры.

Устройство сенсорной мембраны проточной ячейки R9


При изготовлении ячейки нанопоры закрепляют на сенсорной мембране путем подачи напряжения. Уровень напряжения подобран таким образом, чтобы итоговое количество нанопор в каждой ячейке составляло 12 000 штук (теоретический максимум).

Количество электродов в сенсорной матрице также равняется 12 000. И в идеальном случае одному электроду соответствует одна рабочая нанопора.

Каждые 4 электрода объединены в один электронный канал для контроля напряжения и детекции ионного тока на каждой из 4-х соответствующих нанопор. Таким образом, общее количество электронных каналов (и групп нанопор) в проточной составляет 3 000 штук.

Нанопоры в группе расположены в определенном порядке и позициях. В любой момент времени секвенирование происходит только на одной поре из четырех. Внутри одного канала поры используются по очереди.

Закрепленная под сенсорной матрицей интегральная микросхема ASIC предназначена для усиления и передачи сигнала от электронных каналов к управляющей станции, а также контроля параметров детекции в соответствии с командами, поступающими от программного обеспечения.

Установка проточной ячейки в секвенатор PromethION

Прайминг проточной ячейки PromethION и внесение образца

С этим товаром покупают

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.