Нанопоровый секвенатор Нанопорус ПРО

Нанопорус ПРО — это компактный настольный нанопоровый секвенатор, предназначенный для работы с двумя проточными ячейками. Каждая проточная ячейка имеет независимую адресацию, что позволяет проводить эксперименты одновременно или по отдельности. «Нанопорус ПРО» подключается к GridION Mk1 или пользовательскому компьютеру для потоковой передачи и анализа данных в режиме реального времени.

Преимущества секвенатора Нанопорус ПРО

• -400 ГБ максимальная производительность
• 15+ приложений WGS, метагеномика, транскриптомика, таргетное секвенирование
• Улучшенная электроника.
• Готовые рабочие пайплайны: 16S, SARS-COV-2, NO-MISS, gDNA, cDNA.
• Полная совместимость с проточными ячейками MinION, адаптером и проточными ячейками Flongle.
• Мобильность использования;
• Возможность остановки запуска в любой момент времени.
• Операционная система Windows – 10, Linux – Ubuntu
• Размер и вес: 150 х 150 х 135 мм | 2,5 кг.

Руководство пользователя Nanoporus Pro

Технология нанопорового секвенирования

Ключевым компонентом (и основным расходным материалом) нанопровых секвенаторов является проточная ячейка.

Процесс секвенирования происходит в камере ячейки, содержащей непроводящую мембрану, в которую встроены проводящие белковые нанопоры. Обе стороны мембраны омывают растворы электролитов.

Во время пробоподготовки к концам фрагментов нуклеиновых кислот пришиваются специальные моторные белки. При попадании образца в камеру проточной ячейки эти белки связываются с нанопорами.

При запуске прибора между сторонами мембраны возникает разность потенциалов. Под действием электрического поля и при участии молекул АТФ моторные белки расплетают двухцепочечную нуклеиновую кислоту и направляют одну из цепей в нанопору. (При этом вторая цепь может присоединиться к соседней поре либо остаться в растворе.)

Дальнейшее движение фрагмента нуклеиновой кислоты через канал осуществляется за счет его отрицательного заряда. Одновременно с исследуемой молекулой под напряжением через нанопоры движутся ионы, содержащиеся в растворах электролитов. Поскольку размер нуклеотидов неодинаков, величина ионного тока зависит от последовательности участка нуклеиновой кислоты, проходящего через канал в данный момент времени. В ходе секвенирования происходит регистрация этого тока.

Таким образом, первичные данные нанопорового секвенирования представляют собой совокупность скачков силы тока ионов.

После секвенирования одного фрагмента нанопора остается активной и может аналогично пропустить через себя множество других цепей нуклеиновых кислот.

Бейсколлинг – распознавание нуклеотидов по исходному сигналу – осуществляет специальное программное обеспечение.

Области применения секвенатора Нанопорус

• Полногеномное секвенирование de novo и ресеквенирование,
• Облегчение сборки данных, полученных на других секвенаторах,
• Детекция хромосомных аберраций,
• Исследование альтернативного сплайсинга,
• Определение копийности определенных последовательностей,
• Анализ экспрессии генов,
• Углубленное исследование образцов бактериального метагенома (с предварительной амплификацией полного гена 16S рРНК),
• Детекция модифицированных нуклеотидов,
• Анализ профиля метилирования и др.

Структура каждого элемента: слева PDF-иконка, справа название документа. Документы расположены вертикально, а ссылки открываются в новой вкладке через target="_blank". Атрибут rel="noopener noreferrer" закрывает связанную с новой вкладкой уязвимость.

По вопросам обращайтесь на sales@skygen.com