С гордостью хотим сообщить, что наши коллеги из ФГБУ «НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева» Минздрава России первыми в России осуществили секвенирование полного генома коронавируса SARS-CoV-2 из материала от пациента с COVID-19.
Полученный геном, получивший название hCoV-19/Russia/StPetersburg-3524/2020, доступен в международной базе данных по мониторингу глобальной эволюции коронавируса нового типа GISAID.
Данный эксперимент был реализован с помощью протокола ARTIC на нанопоровом секвенаторе MinIon (Oxford Nanopore Technologies, UK).
Портативный нанопоровый секвенатор MinION от компании Oxford Nanopore Technologies с использованием протокола ARTIC позволяет менее чем за 8 часов получить полную последовательность генома вируса. За основу протокола взят результат и опыт работы с вирусом Эбола в период эпидемии 2013-2016 гг.