расходные материалы
для лабораторий
Первое в России секвенирование полного генома коронавируса!
Дорогие друзья!
С гордостью хотим сообщить, что наши коллеги из ФГБУ «НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева» Минздрава России первыми в России осуществили секвенирование полного генома коронавируса SARS-CoV-2 из материала от пациента с COVID-19.
Полученный геном, получивший название hCoV-19/Russia/StPetersburg-3524/2020, доступен в международной базе данных по мониторингу глобальной эволюции коронавируса нового типа GISAID.
Данный эксперимент был реализован с помощью протокола ARTIC на нанопоровом секвенаторе MinIon (Oxford Nanopore Technologies, UK).
Портативный нанопоровый секвенатор MinION от компании Oxford Nanopore Technologies с использованием протокола ARTIC позволяет менее чем за 8 часов получить полную последовательность генома вируса. За основу протокола взят результат и опыт работы с вирусом Эбола в период эпидемии 2013-2016 гг.
- Протокол ARTIC доступен для скачивания пользователями в Nanopore Community (протокол PCR tiling of COVID-19 virus).
- Для реализации протокола требуются праймеры к COVID-19, набор SQK-LSK109, а также ферменты для проведения реакций пробоподготовки.
- Анализ полученных результатов осуществляется в режиме реального времени с помощью программного обеспечения RAMPART.
-
Для амплификации генома вируса используется самая точная в мире полимераза Q5 от компании New England Biolabs.
