Новейшие публикации с продуктами для NGS из каталога SkyGen

NGS эксперименты уже давно прочно вошли в список рутинных задач любого молекулярного биолога. Практически во всех исследованиях учёные секвенируют образцы, чтобы подтвердить ту или иную гипотезу. И в то же время, сейчас многие сталкиваются с проблемой поставок, выбора доступных аналогов и сменой привычных протоколов.

Так как же понять, какой продукт подойдёт именно вам? Как проверить, что качество новых реагентов будет на высоком уровне? Отвечает команда научной поддержки SkyGen: нужно довериться опыту других исследователей по всему миру!

Поэтому мы решили собрать для вас небольшой список свежих публикаций исследований, в которых использовались продукты для NGS из нашего каталога.

Vazyme

IRX2 регулирует индуцированный ангиотензином II фиброз сердца путем транскрипционной активации EGR1 у мышей-самцов

Фиброз сердца является распространенным признаком хронической сердечной недостаточности. Семейство транскрипционных факторов IRX играет важную роль в развитии сердца, однако роль IRX2 при фиброзе сердца не выяснена. В этой работе исследователи из Уханьского университета обнаружили, что экспрессия IRX2 значительно повышается в фиброзных сердцах. Также они доказали, что IRX2 регулирует путь EGR1 при стимуляции ангиотензином II и вызывает фиброз сердца.

Благодаря набору «VAHTS Universal DNA Library Prep Kit» учёные смогли подготовить библиотеку для платформы Illumina.

Новый метод синтеза библиотек гидовых РНК и функционального картирования областей H3K4me3 млекопитающих

Генетический скрининг, основанный на CRISPR системе является отличным инструментом для идентификации регуляторных генов или цис-элементов. Однако при применении этого вида скрининга для точного определения функциональных элементов в определенных локусах может потребоваться большое количество гидовых РНК.

Учёные из Чжэцзянского университета разработали метод для синтеза библиотек гидовых РНК с интересующими областями генома. Применяя этот подход к ДНК клеток млекопитающих, полученной с помощью иммунопреципитации хроматина, они провели скрининговые эксперименты для аннотирования важных участков клеточной пролиферации. Этот метод потенциально может быть автоматизирован с высокой эффективностью при низких затратах и может широко использоваться для идентификации функциональных элементов в геномах млекопитающих.

В своей работе исследователи использовали набор «VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit» для создания библиотек для платформы Illumina.

Преждевременное старение скелетных стволовых клеток/клеток-предшественников, а не остеобластов, вызывает потерю костной массы со снижением механосенсации

Была идентифицирована особая популяция скелетных стволовых клеток/клеток-предшественников, которая необходима для поддержания и ремоделирования скелета взрослого человека. Однако типы клеток, которые ответственны за возрастную потерю костной массы, и характерные изменения в этих клетках во время старения еще предстоит определить. В этой работе учёные из Китайской Академии Наук создали модели преждевременного старения путем условного истощения Zmpste24 (Z24) у мышей и обнаружили, что Prx1-зависимая делеция Z24, но не Osx-зависимая делеция Z24, вызывала значительную потерю костной массы. Секвенирование РНК отдельных клеток выявило две популяции скелетных стволовых клеток/клеток-предшественников, которые ответственны за потерю костной массы, связанную с преждевременным старением.

Для создания NGS-библиотек учёные использовали набор «TruePrep DNA Library Prep Kit V2» и адаптеры «TruePrep Index Kit V2».

Diagenode

Изменения в эпигенетическом ландшафте гепатоцитов при стеатозе

Известно, что накопление жира в печени, поражает множество людей по всему миру. Это сопряжено с повышенным риском развития фиброза, цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Тем не менее, мало что известно о влиянии диеты с высоким содержанием жиров и алкоголя на эпигенетическое старение в отношении изменений в транскрипционном и эпигеномном профилях. В этом исследовании группа немецких учёных использовала мультиомный подход и изучала экспрессию генов, сигналы метилирования и сигналы хроматина для оуценки эпигеномных эффектов диеты с высоким содержанием жиров и алкоголя на гепатоциты мышей. Они идентифицировали четыре соответствующих кластера генной сети, которые были связаны с соответствующими путями, способствующими развитию стеатоза. Используя подход машинного обучения, им удалось спрогнозировать конкретные факторы транскрипции, которые могут быть ответственны за модуляцию функционально значимых кластеров.

В своей работу исследователи использовали соникатор Bioruptor, а также набор «Auto Histone ChIP Kit».

Характеристики и корреляции взаимосвязи между вирусом слизистой оболочки кишечника и колоректальным раком

В этом исследовании сотрудники Гуанчжоуского университета впервые провели анализ вирома слизистой оболочки у пациентов с колоректальным раком (КРР) по сравнению со здоровыми контрольными группами и показаны различия между ними. В отличие от изменений в фекальном вироме при КРР (в основном связанных с бактериофагами), это исследование показало, что в различиях в вироме слизистой оболочки между КРР и здоровыми контролями преобладали эукариотические вирусы, отличные от бактериофагов. Обогащение TTV, одного из подвидов семейства Anelloviridae, тканей КРК позволяет предположить, что они могут играть важную онкогенную роль при КРР, что проложит путь к инновационным терапевтическим стратегиям, блокирующим или обращающим вспять патогенез КРР в будущем.

В этой работе учёным помогал соникатор Bioruptor Pico.

Как видите, продукты Vazyme и Diagenode подходят для исследований в различных областях, помогая исследователям по всему миру решать важные и интересные задачи.

А заказать любые товары от этих и других брендов вы можете, отправив заявку на sales@skygen.com.

Если вам требуется научная поддержка или помощь с подбором – пишите на help@skygen.com.

Каталог Vazyme    Каталог Diagenode