#58 Обзор продукции компании MicroGEM

На сегодняшний день существует множество различных методик выделения нуклеиновых кислот (НК). Они различаются в зависимости от типа биоматериала и целей дальнейшего исследования. Однако, несмотря на большое разнообразие этих методов, большинство из них имеет существенные недостатки, такие как: использование опасных химикатов, низкий выход или фрагментация выделяемых НК, низкая степень очистки НК, а также большие время- и трудозатраты.

Новозеландская компания MicroGEM представляет новую технологию выделения ДНК и РНК, в основе которой лежит работа термофильных и мезофильных ферментов при различных температурных условиях. Данный подход является более экологичным, простым и быстрым по сравнению с традиционными методами экстракции НК.

Преимущества метода

Технология компании MicroGEM имеет ряд преимуществ по сравнению с традиционными методами экстракции:

• Высокий выход
• Высокая скорость
• Большая сохранность образца


• В состав не входят детергенты и денатурирующие вещества
• Нет промежуточных этапов, в которых раствор переносится в другие пробирки
• Нет потерь нуклеиновых кислот


• Меньше количество используемого пластика и вредных отходов
• Меньше время работы лабораторного персонала
• Ниже риск контаминации

Продукция компании MicroGEM будет особенно интересна специалистам, которые работают с очень маленькими объемами биоматериала.

Технология

Прибор для выделения нуклеиновых кислот PDQeX координирует работу термофильных и мезофильных ферментов, разрушающих клеточную стенку, и протеиназ в специальном картридже (Рис.1) и создает закрытую систему для лизиса клеток, разрушения нуклеаз, расщепления белков и высвобождения нуклеиновых кислот. При таком подходе снижается риск контаминации, образец не нуждается в дополнительной лабораторной обработке, и экстракция занимает существенно меньшее количество времени по сравнению с традиционными методами.

Рис.1. Инновационный картридж MicroGEM.

Более того, прибор для экстракции PDQeX необходим только для экспериментов, в которых нужна повышенная чистота образца. В обычных случаях для этапов нагрева можно использовать стандартный амплификатор или термостат.

Схема процесса выделения НК на приборе PDQeX выглядит следующим образом:

При экстракции без прибора PDQeX в пробирку или лунку планшета вносят реагенты MicroGEM и образец, а затем ставят в амплификатор или термостат по протоколу, заданному в инструкции.

Полученный таким способом образец пригоден для дальнейших исследований методами ПЦР, количественной ПЦР, STR и полногеномного секвенирования.

Прибор для выделения нуклеиновых кислот PDQeX

Прибор для выделения нуклеиновых кислот PDQeX предназначен для выделения ДНК и РНК из различных видов биоматериала. В зависимости от типа образца в приборе есть установленные программы экстракции, а также есть возможность записать необходимую программу самостоятельно.

Для выделения НК на приборе необходимы реагенты для экстракции из соответствующего типа биоматериала. Также компания MicroGEM предоставляет решения как для научно-исследовательских, так и для судебно-криминалистических целей. В состав любого набора входят все необходимые реагенты и стерильные картриджи, рассчитанные на 50, 100, 500 или 1 000 реакций.

В прибор PDQeX вмонтированы УФ-лампы, что позволяет проводить стерилизацию внутри реакционного блока и снизить риск контаминации до минимума.

Биологический материал

Прибор PDQeX имеет несколько программ выделения НК, которые различаются в зависимости от типа биологического материала: бактерии, растения, клеточная культура, кровь, ткань, слюна, сперма. 

Почти все наборы представлены в двух вариантах: для автоматической работы на приборе и для работы со стандартным лабораторным оборудованием (в данном случае для нагрева может использоваться термоциклер или термостат). 

Также для выделения из крови, слюны и ткани есть две разновидности комплектов реагентов – для судебных или научно-исследовательских целей.

Набор prepGEM Bacteria для выделения ДНК из бактерий

Набор prepGEM Bacteria предназначен для выделения ДНК грамположительных и грамотрицательных бактерий, протистов и архей из колоний, жидких культур, биопленок, слизи, мазков, земли, кала и воды.

Время экстракции:

Сравнение выделения ДНК из бактерий по протоколу MicroGEM и двумя другими наиболее распространенными методиками:

Как можно заметить на рисунке, выделение способом MicroGEM значительно быстрее, содержит намного меньше ручных этапов, а также при таком способе выделения НК ниже риск контаминации и меньше расходного пластика используется.

Набор PDQeX phytoGEM для выделения ДНК из растений, растительных патогенов и грибов

Набор PDQeX phytoGEM предназначен для выделения ДНК из листьев, стеблей и корней растений, а также растительных патогенов и грибов.

Время экстракции: 12 минут.

Для выделения подходят гомогенизаты растительных тканей, культуры грибов. Также компания MicroGEM предлагает простой и быстрый способ для длительного хранения растительных образцов на специальных карточках PhytoCards:

Лист помещают в карточку с абсорбирующей поверхностью и зажимают специальными пассатижами, тем самым оставляя след от листа на карточке. В таком виде растительный образец можно хранить длительное время, а также использовать для выделения ДНК.

Сравнение выделения ДНК из листа по протоколу MicroGEM и двумя другими наиболее распространенными методиками:

Как можно заметить на рисунке, выделение способом MicroGEM значительно быстрее, содержит намного меньше ручных этапов, а также при таком способе выделения НК ниже риск контаминации и меньше расходного пластика используется.

Набор prepGEM Universal для выделения ДНК из крови, тканей и слюны

Набор prepGEM Universal предназначен для выделения ДНК из образцов крови (жидкая кровь, мазок, сухие капли крови), ткани (тканевые и клеточные культуры, животная ткань, хвосты мышей и крыс, образцы ушей, плавники рыб, насекомые) и слюны (жидкая слюна, соскоб буккального эпителия, сухие пятна) для научно-исследовательских целей.

Время экстракции:

Сравнение выделения ДНК из крови по протоколу MicroGEM и двумя другими наиболее распространенными методиками:

Как можно заметить на рисунке, выделение способом MicroGEM значительно быстрее, содержит намного меньше ручных этапов, а также при таком способе выделения НК ниже риск контаминации и меньше расходного пластика используется.

Набор forensicGEM Universal для выделения ДНК из судебно-криминалистических образцов

Набор forensicGEM Universal предназначен для выделения ДНК из образцов слюны (жидкая, мазок, сухие пятна, окурки), крови (жидкая, мазок, сухие пятна) и тканей (твердые образцы тканей, волосы).

Время экстракции:

Сравнение выделения ДНК из мазков буккального эпителия по протоколу MicroGEM и двумя другими наиболее распространенными методиками:

Как можно заметить на рисунке, выделение способом MicroGEM значительно быстрее, содержит намного меньше ручных этапов, а также при таком способе выделения НК ниже риск контаминации и меньше расходного пластика используется.

Набор forensicGEM Sperm для выделения ДНК из семенной жидкости 

Набор forensicGEM Sperm предназначен для экстракции ДНК из сперматозоидов, семенной жидкости, сухих пятен семенной жидкости и урогенитальных мазков для использования в судебно-криминалистических целях.

Время экстракции: 9 минут.

Сперматозоиды являются материалом, тяжелым для лизиса, поэтому в состав реактивов обычно входят такие реагенты, как SDS, меркаптоэтанол и DTT. Эти химикаты ингибируют ПЦР и STR и требуют дополнительных стадий очистки, которые занимают больше времени и ведут к потерям ДНК.

Набор RNAGEM для выделения РНК

RNAGEM – набор реагентов для выделения РНК из 1 - 100 000 клеток. В состав набора входят свободные от РНКаз ферменты, буферы и ДНКаза I. Данный метод выделения подходит для дальнейшей ОТ-ПЦР и количественной ОТ-ПЦР.

Время экстракции: 5-15 минут.

Каталог ↓   Брошюра ↓