#27 Результаты тестирования BrilliantDye в России

Сегодня мы хотим представить долгожданные результаты тестирования нового набора BrilliantDye (альтернативный реагент для BigDye 1.1) от компании Nimagen для проведения реакции с терминаторами, при секвенировании на базе платформы Applied Biosystems.

После того, как мы представили новый продукт в августе, мы получили первую партию здесь, в России, и провели эксперименты в дружественной нам лаборатории в Москве. И в этом обзоре мы кратко расскажем о нашем эксперименте, покажем результаты, а также предоставим возможность скачать файлы с результатами экспериментов.

Ниже можно увидеть результаты секвенирования на платформе ABI 3130, но кратко можно резюмировать результаты проведенных экспериментов следующим образом:

Для секвенирования использовали стандартный образец pGEM плазмиды

В общую реакционную смесь объемом 10 мкл брали 0,5 мкл BrilliantDye, аналога Bigdye 1.1

ВАЖНО: для разбавления смеси для секвенирования необходимо брать специальный буфер для секвенирования: Буфер для секвенирования с BrilliantDye Terminator 5X, который уже сегодня можно заказать.

В остальном придерживались стандартных настроек и условий при постановке эксперимента с Bigdye 1.1

Прибор ABI 3130xl не требовал дополнительной калибровки

Для разбавления использовали буфер для секвенирования от Nimagen

Длина надежного прочтения по результатам проведенных экспериментов в 8 повторах - 700 п.о.

Начало надежного прочтения - 6-9 буква после праймера

При смешивании с готовой смесью Bigdye 1.1 - аналогичные результаты по характеристикам прочтения

При работе использовался полимер NANOPOP7 от Нимаген

На рисунке ниже представлена картина прочтения в начале последовательности. Полный вариант можно скачать, файлы прилагаются к настоящему обзору.

Рис.1. Результаты секвенирования с использованием BrilliantDye с pGEM в качестве матрицы ДНК.

Мы надеемся, что настоящий обзор поможет Вам в будущей работе! Обращайтесь к нам по электронной почте info@skygen.com, и по телефонам!