Вебинары января

Дорогие друзья!

Приглашаем вас на вебинары от ONT и 10x Genomics!

19 января 20:00 (Мск)
Сессия 1: Быстрое обнаружение антигенспецифичных В- и Т-клеток методом баркодирования клеток, с помощью присоединения антигена (BEAM).
10x Genomics, язык вебинара - английский

20 января 06:00 (Мск)
Сессия 2: Быстрое обнаружение антигенспецифичных В- и Т-клеток методом баркодирования клеток, с помощью присоединения антигена (BEAM).
10x Genomics, язык вебинара - английский

Запросить запись

26 января 18:00 (Мск)
Нанопоровое секвенирование ДНК из образцов окружающей среды: в лаборатории и в полевых условиях.
Oxford Nanopore Technologies, язык вебинара - английский

Запросить запись

Быстрое обнаружение антигенспецифичных В- и Т-клеток методом баркодирования клеток, с помощью присоединения антигена (BEAM)

BEAM - новый метод обнаружения антигенспецифичных В- и Т-клеток, преуспевает там, где традиционные методы потерпели неудачу. Это мультиплексный процесс скрининга антигенов, который позволяет быстро обнаруживать антигенспецифичные клонотипы В-клеток (BEAM-Ab) и Т-клеток (BEAM-T).

Основанный на проверенном рабочем процессе профилирования иммунных клеток, BEAM позволяет проводить скрининг BCR/TCR на наличие предполагаемых антигенов в сочетании с экспрессией генов, секвенированием V(D)J и экспрессией поверхностных маркеров.

Присоединяйтесь к вебинару, чтобы узнать, как метод BEAM может улучшить ваше исследование:

• Идентифицировать и охарактеризовать редкие типы клеток и биомаркеры
• Провести анализ микроокружения тканей, прогрессирования заболевания и иммунного ответа на лекарственные средства
• Провести масштабное обнаружение антител и TCR для новых антигенов
• Охарактеризовать иммунный ответ на инфекцию путем измерения клональной экспансии и фенотипов иммунных клеток.
• Профилировать тысячи генов на уровне отдельной клетки путем штрихкодирования мРНК на 5’-конце для объективной характеристики типов клеток и их состояний
• Одновременно получить профиль иммунного репертуара (BCR/TCR) и экспрессии генов из одной и той же клетки, чтобы обеспечить корреляцию клонотипа с соответствующим подтипом клетки
• Получить парные рецепторные последовательности полной длины из Т-клеток и / или В-клеток с полным разрешением изотипа, предоставляя функциональные данные для обнаружения антител / TCR
• Объединить анализ экспрессии генов с обнаружением сотен белков клеточной поверхности при высоком разрешении для многопараметрической цитометрии
• Использовать таргетные панели для исследования экспрессии генов, чтобы сосредоточиться на наиболее важных генах и ускорить ваши исследования

Спикеры:

	Bruce Adams, PhD		Nur-Taz Rahman, PhD
	Cell Biology Staff Scientist		Applied Bioinformatics Scientist
	10x Genomics		10x Genomics

Запросить запись

Нанопоровое секвенирование ДНК из образцов окружающей среды: в лаборатории и в полевых условиях

Исследователи Лора Урбан и Дэвид Вернер расскажут, как они используют нанопоровое секвенирование для анализа ДНК из образцов окружающей среды (eDNA), поддержки сохранения животных, микробиологического анализа и многого другого.

Неинвазивный динамический мониторинг какапо, находящегося под угрозой исчезновения, в режиме реального времени.

Лара Урбан, главный исследователь Пионерского кампуса Гельмгольца, института искусственного интеллекта им. Гельмгольца и Школы естественных наук Мюнхенского технического университета, расскажет о том, как ее команда использовала неинвазивные геномные подходы в режиме реального времени для мониторинга одной из последних выживших популяций какапо (Strigops habroptilus), находящихся под угрозой исчезновения.

Основываясь на примере какапо, вы узнаете, как: 

• Разработать протокол метабаркодирования ДНК из образцов окружающей среды для определения распределения видов позвоночных, таких как какапо, с использованием образцов почвы.
• Использовать нанопоровое секвенирование в реальном времени для извлечения видоспецифичной ДНК из почвы.
• Как идентифицировать присутствие особей по полученным данным.

Лаборатория молекулярной микробиологии в одном чемодане.

Дэвид Вернер, профессор моделирования экологических систем Ньюкаслского университета, опишет техническую возможность определения характеристик бактериального сообщества с помощью анализа ДНК из образцов окружающей среды, используя только портативное оборудование. 

С этой целью была собрана лаборатория-чемодан, которая включает в себя секвенатор MinION и всё оборудование, необходимое для концентрирования биомассы, выделения, очистки и контроля качества ДНК, а также для подготовки библиотеки для секвенирования.

При помощи этой портативной лаборатории на станции очистки сточных вод в Великобритании и в управлении водоснабжения и канализации Аддис-Абебы в Эфиопии всего за 1 день был выполнен рабочий процесс секвенирования гена 16S рРНК, включающий отбор проб, выделение и очистку ДНК, ПЦР-амплификацию, подготовку библиотеки и непосредственно секвенирование.

Таксономические данные стали доступны в течение 24 - 72 часов, в зависимости от скорости Интернета. 

"Лаборатория в чемодане" также использовалась в Танзании для изучения воздействия выгребных ям на бактериологическую опасность в неглубоких и глубоких грунтовых водах под неофициальным поселением.

Слушатели этой части вебинара узнают:

• Из чего состоит портативная лаборатория молекулярной микробиологии.
• Как валидировать результаты с использованием известных стандартов ДНК и обычных лабораторных методов.
• Как отслеживать источники загрязнения фекалиями и проводить количественную оценку микробного риска.
• Как опыт исследований в Эфиопии, Танзании и Великобритании поможет в вашей работе.

Зарегистрироваться