Как происходит детекция коронавируса

Как детектируют коронавирус

В декабре 2019 года в Ухане, столице китайской провинции Хубэй был идентифицирован новый вирус SARS-CoV2 (который также называют 2019-nCoV или просто «коронавирус»). Наблюдения показали, что вирус передаётся от человека к человеку и вызывает острые респираторные заболевания с инкубационным периодом 2 - 14 дней.

Основываясь на быстром распространении вируса и большом количестве заразившихся (87 000 подтвержденных случаев на начало марта), ВОЗ объявила эту вспышку чрезвычайной ситуацией в области общественного здравоохранения, имеющей международное значение.

Общая информация:

• Геном SARS-CoV2 представлен одноцепочечной (+) РНК
• Близкородственный вирус с SARS-CoV и MERS-CoV
• Детектируется при помощи ПЦР

Тестируют на наличие вируса:

• Людей с острыми респираторными заболеваниями 
• Людей, пребывающих в зонах с неблагоприятной эпидемиологической обстановкой 
• Людей с симптомами респираторных заболеваний, имевших контакт с людьми с подтвержденной COVID-19 

Полный протокол детекции вируса

Компания Analytik Jena предлагает комплексное решение для обнаружения вируса, начиная с забора биоматериала и заканчивая детекцией.

I. ОБРАЗЦЫ

Согласно ВОЗ¹:

• Респираторный биоматериал (носоглоточные или ротоглоточные мазки, мокрота и бронхоальвеолярный лаваж)
• Сыворотка крови для серологических исследований (дополнительно к респираторному биоматериалу)

II. ВЫДЕЛЕНИЕ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ

Analytik Jena предлагает несколько платформ для экстракции НК на выбор, а также наборы для выделения РНК из мазков, бесклеточных жидкостей и пр.:

Набор для выделения вирусной РНК "innuPREP Virus RNA Kit"*

• Набор предназначен для выделения вирусной РНК из различных биологических жидкостей, тканей и мазков
• В состав набора входят реагенты для контроля экстракции
• Используемый биоматериал:
  1. Сыворотка, плазма, другие бесклеточные жидкости и супернатанты от клеточных культур ( до 150 мкл)
  2. Ткани (до 20 мг)
  3. Биопсийный материал (до 20 мг)
  4. Мазки
• Время выделение: 25 минут

*Акция на наборы для выделения вирусной РНК от Analytik Jena -15%. Все подробности уточняйте у своего менеджера.

Инструкция пользователя ↓  

Набор для выделения вирусных ДНК/РНК "innuPREP Virus DNA/RNA Kit"*

• Набор предназначен для выделения вирусных оцДНК, дцДНК и РНК из биологичееских жидкостей, клеток, тканей и мазков
• Запатентованная и оптимизированная химия (DC‑Technology®)
  
• Используемый биоматериал:
1. Сыворотка, плазма, бесклеточные биологические жидкости (до 400 мкл)
2. Ткани и биопсийный материал (до 20 мг)
3. Мазки
• Время выделения: 25 минут

*Акция на наборы для выделения вирусной РНК от Analytik Jena -15%. Все подробности уточняйте у своего менеджера.

Инструкция пользователя ↓  

III. АМПЛИФИКАЦИЯ И ДЕТЕКЦИЯ

Были разработаны молекулярные тесты для детекции SARS-CoV-2², а также доступны несколько коммерческих наборов для детекции вируса при помощи ПЦР в реальном времени:

• Coronavirus (штамм 2019-nCoV) от Genesig/Primerdesign
• SARS-CoV-2 детекция от TIB MOLBIOL
• RIDA® GENE Novel Coronavirus 2019 RUO тест от r-biopharm

Смеси для ПЦР раскапывают вручную или можно использовать автоматические станции (CyBio Felix). Использование автоматических систем позволяет уменьшить риск контаминации и повысить точность результатов. Отдельные компоненты, такие как обратная транскриптаза или готовые смеси для ПЦР также доступны для заказа в портфолио Analytik Jena. Для проведения ПЦР в реальном времени можно использовать амплификаторы панели qTOWER³.

Список литературы:

1. Laboratory testing for 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) in suspected human cases.
2. Coronavirus disease (COVID-19) technical guidance: Laboratory testing for 2019-nCoV in humans.