Дорогие друзья! Уважаемые коллеги!
Мы с удовольствием хотим обратить ваше внимание на оборудование от компании Bruker, а именно систему MALDI Biotyper, предназначенную для экспресс-идентификации микроорганизмов.
MALDI Biotyper — программно-аппаратный комплекс, предназначенный для быстрой идентификации микроорганизмов с использованием MALDI-TOF масс-спектрометров серии FLEX.
Метод выявляет уникальный набор белков исследуемых микроорганизмов — своеобразный «отпечаток пальца». Идентификация происходит в основном по рибосомальным белкам, которые встречаются во всех микроорганизмах.
Идентификация МО на MALDI-TOF MS
• MALDI Biotyper — программно-аппаратный комплекс, предназначенный для быстрой идентификации микроорганизмов с использованием MALDI-TOF масс-спектрометров серии FLEX
• Метод выявляет уникальный набор белков исследуемых микроорганизмов — своеобразный «отпечаток пальца»
• Идентификация происходит в основном по рибосомальным белкам, которые встречаются во всех микроорганизмах
• Биоинформационная модель, основанная на анализе белков, позволяет надёжно и точно проводить идентификацию конкретного микроорганизма до вида путём сопоставления получаемых масс-спектров белков с обширной базой данных
Характеристики метода:
• Чувствителен — предел измерения 104-107 клеток
• Метод независим от свойств культуры или среды
• Быстрая и простая пробоподготовка: до 5 минут / образец
• Скорость измерения: ~ 1 мин / образец
• Возможность автоматизации всех стадий исследования
• Точность идентификации порядка 97-99%
• Низкая себестоимость: от 5 до 15 руб / образец
• Открытая система базы данных — возможность создания собственных баз и обмен ими с другими пользователями
Содержание базы данных
• Каждая запись MSP содержит больше 25 спектров
• Каждая запись подтверждена методом секвенирования НК
• База данных содержит как клинически-значимые микроорганизмы, так и ветеринарные, промышленные и очень редкие.
Протокол пробоподготовки для идентификации микроорганизмов с помощью системы MALDI Biotyper:
• Отбор единичной колонии с чашки Петри с помощью зубочистки или бактериологической петли
• Нанесение этой колонии в лунку на металлической мишени
• Нанесение низкомолекулярной матрицы, которая помогает ионизировать белки и предохраняет их от лазерного излучения
• Помещение этой мишени в масс-спектрометр
• Создание проекта и запуск автоматического сбора данных
• Получение результатов идентификации
Таким образом, в среднем на анализ одного образца уходит 5 минут, на анализ 100 образцов — около 1 ч.
Так выглядит спектр полученных белков микроорганизма. Каждый «пучок» на этом спектре — белок или пептид.
По оси абсцисс отображаются масса, по оси ординат — интенсивность сигнала.
В принципе оператор может сразу сказать какая масса у белка и, зная массу интересующих его белков, понять присутствует ли какой-либо белок у этого микроорганизма.
Также масс-спектрометр позволяет проводить идентификацию многоклеточных организмов, спор, токсинов, то есть любых веществ или биоматериала, которые содержат белки, липиды, полисахариды.
Компания Bruker имеет набор готовых решений для любого пользователя
Готовые решения компании Bruker под следующие задачи:
Получить все подробности, а также сделать заказ можно по электронной почте info@skygen.com, или по телефонам +7 (495) 215 02 22, а также по бесплатной линии 8 (800) 333 12 26.
Редактирование геномов: большой обзор о технологии и решениях.
Обновление линейки продуктов компании New England Biolabs