#31 Всего 500 пкг ДНК? Да, вы можете секвенировать на платформе Illumina!

Введение:

Для всех, кто сталкивается с задачей увеличения выхода библиотеки NGS, при этом в условиях уменьшающегося количества материала, который используется для приготовления библиотеки наш новый набор Ultra II. Каждый компонент набора NEBNext Ultra II для приготовления библиотек из геномной ДНК от New England Biolabs был изменен, в результате выход библиотек вырос несколько раз - а для приготовления библиотеки может использоваться до 500 пкг стартового материала.

В результате вы получаете великолепную производительность, что особенно приятно - это происходит одновременно с уменьшением количества циклов ПЦР в протоколе пробоподготовки. С использованием отдельных вариаций протокола - становится возможным даже протокол без этапа ПЦР.

Таким образом - если вы хотите получить даже больше из меньшего количества материала - то набор Ultra II - решение для вас! Если вы не уверены, что все обещанные характеристики помогут в вашем конкретном случае - напишите нам (info@skygen.com), и мы в течение 1 месяца предоставим вам бесплатный набор на 6 реакций. В комплекте с набором

Преимущества набора NEBNext Ultra II для приготовления геномных библиотек для Illumina®:

Возможность получить большее количество библиотеки, чем обычно, с более высоким выходом библиотеки

Получение библиотек высокого качества даже при использовании лимитированного количества исходного образца ДНК, с количеством от 1 мкг до 500 пкг

Приготовить библиотеки из ВСЕХ ваших образцов, включая GC-богатые случаи, и образцы ДНК, полученной из парафиновых блоков (FFPE)

Улучшить выход при использовании протокола гибридизационного обогащения (например, совместно с протоколом обогащения панелями xGEN)

Экономить время благодаря ускоренному протоколу, уменьшению времени работы руками и возможностями протоколов автоматизации. Вы сможете наслаждаться универсальностью протокола и возможностью закупать каждый этап отдельно в виде модуля

Возможность реализации протокола БЕЗ этапа ПЦР - PCR-free протокола

    

Рис.1. Результаты измерения выхода библиотек NGS. Библиотеки были приготовлены из геномной ДНК NA19240. Количество циклов ПЦР и количества вносимой ДНК указаны.

Очень важным этапом секвенирования NGS - является грамотная оценка количества и качества приготовленной библиотеки - что может быть легко осуществлено при помощи набора для оценки количества библиотеки. Об этом наборе и обо всей линейке NEBNext возможно прочитать в брошюре, которая доступна к скачиванию в приложении к данному обзору.

Протокол может быть реализован как при помощи готового набора, так и при помощи отдельных модулей:

Набор NEBNext Ultra II для приготовления геномных библиотек (NEB #E7645)

Модуль NEBNext Ultra II для этапа восстановления концов/dA-модификации (NEB #E7546)

Модуль NEBNext Ultra II для этапа лигирования (NEB #E7595)

Модуль NEBNext Ultra II Q5 для этапа амплификации (NEB #M0544)

Мы надеемся, что наш новый набор заинтересует как продвинутых пользователей Illumina, так и начинающих работать в этой отрасли. Кроме наборов для приготовления геномных библиотек мы также предлагаем наборы для приготовления библиотек РНК, малых РНК, наборы олигонуклеотидов с индексами, совместимыми с платформой Illumina.