Система для фрагментации ДНК для пробоподготовки NGS Соникатор Bioruptor® Pico

Соникатор Bioruptor® Pico – последняя разработка в области фрагментации с возможностью получения фрагментов размером от 150 до 1000 п.о. 

Области применения данной технологии охватывают исследования окружающей среды, токсикологию, геномику и эпигеномику, исследования в области онкологии, стволовых клеток, неврологии и многое другое.

Благодаря широкому выбору расходных материалов, возможна обработка различных объемов биоматериала (диапазон от 20 мкл до 2 мл) в количестве до 16 проб за один запуск прибора. 

Встроенная система охлаждения (Bioruptor® Cooler) обеспечивает высокоточный контроль температуры. Прибор оснащен удобным интерфейсом, в котором как предустановлены стандартные протоколы обработки, так и реализована возможность тонкой настройки параметров под конкретные задачи. Подробная информация по использованию прибора представлена в инструкции. 

К прибору предлагаются совместимые расходные материалы, а также наборы для фрагментации.

Строение прибора

Области применения

• Фрагментация ДНК для пробоподготовки библиотек NGS – подробнее о выборе протокола
• Фрагментация хроматина
• Экстракция белков из тканей и клеток (в том числе для масс-спектрометрии)
• Экстракция ДНК из FFPE-образцов
• Исследование агрегации белков

Воспроизводимость результатов

Рис. 1. Образцы ДНК объемом 50 мкл были фрагментированы в пробирках 0,2 мл в трех независимых экспериментах на приборе Bioruptor Pico (13 циклов по 30/30 секунд ON/OFF), после чего были проанализированы на капиллярном гель-электрофорезе (Agilent). Средний размер фрагментов 197 п.о.±3,7%.

Рис. 2. Образцы ДНК объемом 50 мкл были фрагментированы в пробирках 0,2 мл в трех независимых экспериментах на приборе Bioruptor Pico (4 цикла по 30/30 секунд ON/OFF), после чего были проанализированы на капиллярном гель-электрофорезе (Agilent). Средний размер фрагментов 349 п.о.±5%.