Реактивы и оборудование
для лабораторий

# 39 Система MALDI Biotyper для экспресс-идентификации микроорганизмов

Дорогие друзья! Уважаемые коллеги!

Мы с удовольствием хотим обратить ваше внимание на оборудование от компании Bruker, а именно систему MALDI Biotyper, предназначенную для экспресс-идентификации микроорганизмов.

MALDI Biotyper — программно-аппаратный комплекс, предназначенный для быстрой идентификации микроорганизмов с использованием MALDI-TOF масс-спектрометров серии FLEX.
Метод выявляет уникальный набор белков исследуемых микроорганизмов — своеобразный «отпечаток пальца». Идентификация происходит в основном по рибосомальным белкам, которые встречаются во всех микроорганизмах.

Идентификация МО на MALDI-TOF MS

• MALDI Biotyper — программно-аппаратный комплекс, предназначенный для быстрой идентификации микроорганизмов с использованием MALDI-TOF масс-спектрометров серии FLEX
• Метод выявляет уникальный набор белков исследуемых микроорганизмов — своеобразный «отпечаток пальца»
• Идентификация происходит в основном по рибосомальным белкам, которые встречаются во всех микроорганизмах
• Биоинформационная модель, основанная на анализе белков, позволяет надёжно и точно проводить идентификацию конкретного микроорганизма до вида путём сопоставления получаемых масс-спектров белков с обширной базой данных

Характеристики метода:

• Чувствителен — предел измерения 104-107 клеток
• Метод независим от свойств культуры или среды
• Быстрая и простая пробоподготовка: до 5 минут / образец
• Скорость измерения: ~ 1 мин / образец
• Возможность автоматизации всех стадий исследования
• Точность идентификации порядка 97-99%
• Низкая себестоимость: от 5 до 15 руб / образец
• Открытая система базы данных — возможность создания собственных баз и обмен ими с другими пользователями

Содержание базы данных

• Каждая запись MSP содержит больше 25 спектров
• Каждая запись подтверждена методом секвенирования НК
• База данных содержит как клинически-значимые микроорганизмы, так и ветеринарные, промышленные и очень редкие.

Рисунок2.jpg

Протокол пробоподготовки для идентификации микроорганизмов с помощью системы MALDI Biotyper:

• Отбор единичной колонии с чашки Петри с помощью зубочистки или бактериологической петли
• Нанесение этой колонии в лунку на металлической мишени
• Нанесение низкомолекулярной матрицы, которая помогает ионизировать белки и предохраняет их от лазерного излучения
• Помещение этой мишени в масс-спектрометр
• Создание проекта и запуск автоматического сбора данных
• Получение результатов идентификации

Таким образом, в среднем на анализ одного образца уходит 5 минут, на анализ 100 образцов — около 1 ч.

Безымянный.png

Так выглядит спектр полученных белков микроорганизма. Каждый «пучок» на этом спектре — белок или пептид.

По оси абсцисс отображаются масса, по оси ординат — интенсивность сигнала.

В принципе оператор может сразу сказать какая масса у белка и, зная массу интересующих его белков, понять присутствует ли какой-либо белок у этого микроорганизма.

Также масс-спектрометр позволяет проводить идентификацию многоклеточных организмов, спор, токсинов, то есть любых веществ или биоматериала, которые содержат белки, липиды, полисахариды.

Компания Bruker имеет набор готовых решений для любого пользователя

  • масс-спектрометр
  • программные пакеты
  • руководство для пользователей
  • стандартные протоколы
  • колонки и стандарты
  • предустановленные методы
  • базы данных

Готовые решения компании Bruker под следующие задачи:
  • Контроль качества продуктов питания. Пестициды, диоксины, экотоксиканты
  • Ветеринарный контроль
  • Анализ лекарственных препаратов, гормонов
  • Экологический мониторинг
  • Допинг-контроль
  • Токсикологический скрининг
  • Фармакодинамика, фармакокинетика
  • Протеомика, геномика, метаболомика
  • Идентификация микроорганизмов, паразитарных заболеваний человека, животных и растений

Получить все подробности, а также сделать заказ можно по электронной почте info@skygen.com, или по телефонам +7 (495) 215 02 22, а также по бесплатной линии 8 (800) 333 12 26.

к списку обзоров