10x Genomics

10x Genomics - американская компания, которая предлагает уникальную систему пробоподготовки к высокопроизводительному анализу генома, экзома, транскриптома, CNV и др. единичных клеток методом NGS на платформе Illumina. Компания SkyGen является дистрибьютором продукции 10x Genomics в России и СНГ.

   

Каталог приборов 10x Genomics

• Станция Chromium Connect
• Станция Chromium™ Controller для работы с единичными клетками и молекулами
• Станция Chromium™ X для работы с единичными клетками и молекулами
• Станция Visium CytAssist

Независимо от того, начинаете ли вы работать с единичными клетками, расширяете свои возможности или ищете автоматизированный способ разделения клеток и создания баркодированных библиотек, готовых к секвенированию, вы найдете необходимое решение в линейке приборов от 10X Genomics. Проверенная технология Next GEM обеспечивает надежные решения для улучшения вашего понимания разнообразия и функций клеток.

Компания 10x Genomics inc. - лидер в области разработки и производства оборудования для single cell секвенирования. Технологии 10x Genomics успешно применяются исследователями по всему миру. Приборы производства компании используются в каждом из 100 ведущих мировых исследовательских институтов, согласно рейтингу Nature в 2019 году, и в каждой из 20 ведущих мировых фармацевтических компаний, согласно рейтингу по расходам на исследования и разработки в 2019 году. Продукты 10x Genomics упомянуты в более чем 2500 научных статьях, и благодаря им ученые совершали открытия в области онкологии, иммунологии и нейробиологии.

10x genomics inc. - компания, основанная в 2012 году в Калифорнии, США. Наибольший интерес компании составляет исследование единичных клеток: 10x genomics производит высокотехнологическое[АА1] оборудование, химические реактивы и необходимое программное обеспечение, позволяющее получить максимально возможное пространственное разрешение для изучения биологических систем. Продукты и технологии компании предлагают готовые решения в таких областях, как single cell RNA-seq (секвенирование РНК единичных клеток), single cell ATAC-seq, иммунопрофилирование на уровне единичных клеток, а также изучение пространственной экспрессии генов в тканях.

Анализ единичных клеток широко применяется в иммунологии и онкологии для секвенирования B-клеточных и Т-клеточных рецепторов, измерения экспрессии генов сигнальных путей и поверхностных белков и определения антигенной специфичности. Разрешение на уровне единичных клеток позволяет изучать клональную экспансию и клональное разнообразие иммунных клеток путем секвенирования B- и Т-клеточных рецепторов, и на основе полученных данных разрабатывать новые методы клеточной терапии онкологических заболеваний. Измерение экспрессии генов при помощи single cell RNA-seq в комбинации с иммунофенотипированием на уровне единичных клеток помогает ученым определять подмножества иммунных клеток и их функциональные состояния. Захват парных Т-клеточных рецепторов и мультимерных комплексов пептид-MHC, тяжелых и легких цепей иммуноглобулина и их родственных антигенов в сочетании с секвенированием единичных клеток позволяет оценить специфичность адаптивной иммунной системы.

Компания 10x genomics предлагает готовое решение для пробоподготовки образцов перед секвенированием единичных клеток на платформе Illumina - станцию Chromium Controller. В приборе используются передовые микрофлюидные технологии для заключения отдельных клеток в эмульсионные капли и баркодирования их генетического материала за считанные минуты. Chromium Controller позволяет произвести пробоподготовку для широкого круга исследований: анализа транскриптомного профиля единичных клеток (single cell transcriptomics) опухолевого микроокружения, определения репертуаров T- и B-клеточных рецепторов опухоль-инфильтрующих клеток, анализа доступности хроматина на уровне единичных клеток (single cell ATAC-seq), и многих других. Но главным достоинством станции можно считать максимальную автоматизацию и стандартизацию протоколов пробоподготовки.

Chromium Controller от 10x genomics inc. совместим с семью готовыми наборами реагентов, подходящих под различные научно-исследовательские цели. Готовые решения для исследователей включают в себя наборы для анализа 3’-экспрессии и 5’-экспрессии генов в единичных клетках (single cell RNA sequencing), наборы для обогащения V(D)J-регионов T-клеток или B-клеток человека и мыши, набор для сборки ДНК de novo, для сборки экзома, для анализа CNV, а также для изучения доступности хроматина методом ATAC-seq.

Исходным образцом для пробоподготовки при помощи Chromium Controller служит суспензия живых клеток в буферном растворе. Далее при помощи микрофлюидных технологий единичные клетки помещаются на чип, проходя по каналам которого они оказываются внутри капли масляной эмульсии, содержащей все необходимые компоненты для подготовки библиотек для секвенирования на платформе Illumina. Каждая капля помимо клетки содержит реагенты для лизиса и RT-PCR, а также олигонуклеотиды с индивидуальным баркодом. Баркод необходим для того, чтобы при анализе данных сгруппировать риды, полученные от каждой единичной клетки.

На нашем сайте доступно к заказу решение для анализа пространственной экспрессии генов в гистологических образцах - Visium. При помощи данной разработки от 10x genomics стало возможным создание высокоточных атласов пространственной экспрессии генов. Технологии single cell sequencing развиваются с каждым днем, и готовые решения от компании 10x genomics позволяют исследователям и компаниям идти в ногу со временем и применять наиболее точные методы для изучения молекулярной биологии и иммунологии.