Реактивы и оборудование
для лабораторий

Набор для полной амплификации генома клетки

Одним из приоритетных направлений разработок компании New England Biolabs является вся линейка ферментов и расходных материалов для ПЦР. Чтобы помочь пользователям ферментов разобраться в многообразии ДНК-полимераз, мы подготовили обзоры, посвященные в том числе изотермальной амплификации и высокоточным ДНК-полимеразам. Отдельно была вынесена информация по ДНК-полимеразе Q5, которая на сегодняшний день является самой точной ДНК-полимеразой на рынке.

Набор для полной амплификации генома клетки позволяет эффективно амплифицировать всю ДНК, содержащуюся в одной клетке, до 2-5 мкг в течение 3 часов (увеличение количества в 1 миллион раз). Длина получаемых при помощи набора ампликонов варьирует от 200 до 1000 п.н.

E2620_1.jpg

Рис. 1 Последовательность действий при проведении 3-х шагового протокола амплификации генома одиночной клетки или 15 пг - 15 нг ДНК.

Преимущества использования набора:

  • Возможность амплификации генома отдельно взятой клетки. Эффективность амплификации единичного бластомера и полярных телец достигает 95%.
  • Набор может быть также применен при необходимости амплификации неопределенного малого количества исходного материала (от одной до тысячи клеток или от нескольких пикограмм до нескольких нанограмм ДНК).
  • Метод позволяет одинаково успешно амлифицировать как AT-, так и GC-богатые регионы.
  • Высокая воспроизводимость: коэффициент корреляции между значениями Ct при повторных ПЦР в реальном времени достигает 90%.
  • Специфичность и высокая эффективность метода могут быть наглядно проиллюстрированы путем сравнения роста кривых амплификации одиночного клеточного генома и отрицательного контроля: нарастание сигнала в пробирках с отрицательным контролем происходит с отставанием, как минимум, в 5 ПЦР-циклов.

E2620_2.jpg

Рис. 2 Амплификационные кривые, полученные при проведении ПЦР при помощи набора для полной амплификации генома клетки в режиме реального времени на приборе Bio-Rad I Cycler iQ.

E2620_3.jpg

Рис. 3 Электрофореграмма разделения продуктов ПЦР в 1,4% агарозном геле. Дорожка 1: отрицательный контроль, дорожки 2 и 3: продукты двух независимых реакций с использованием 15 пг геномной ДНК человека, М: Маркер 2-Log 0.1-10 т.п.н. длин ДНК.

Применение:
Полная амплификация генома клетки для последующих приложений:

  • Анализ вариаций числа копий (Copy Number Variation, CNV),
  • SNP генотипирование,
  • Детекция мутаций,
  • Секвенирование.

В состав набора входят:
Фермент для экстракции ДНК,
Фермент для подготовки к амплификации,
Фермент для амплификации,
Буфер для экстракции,
Буфер для разведения фермента для экстракции,
Реакционная смесь для подготовки к амплификации,
Реакционная смесь для амплификации,
Очищенная от нуклеаз вода.

Температура хранения: -20°С

Примечания:

  1. Пробирки с ферментами следует доставать из холодильника и ставить на планшет со льдом только перед непосредственным их использованием. Остальные компоненты набора можно размораживать на планшете со льдом, а перед использованием их следует перемешать при помощи вортекса.
  2. Набор для полной амплификации генома клетки предполагает работу со сверхнизкими (пикограммы) количествами ДНК, поэтому при работе с ним необходимо соблюдать особую осторожность для предотвращения возможной контаминации.

Артикул Название товара Цена
E2620 S Набор PicoPLEX™ для полной амплификации генома клетки
Концентрация:-    Кол-во:12 реакций  
E2620 L Набор PicoPLEX™ для полной амплификации генома клетки
Концентрация:-    Кол-во:50 реакций  

Указанные на сайте цены включают НДС. Цена указана со склада в Москве

Обычно с этим товаром покупают

Артикул Название товара Цена
B7022 S Краситель для нанесения на гель, оранжевый
Концентрация:6X    Кол-во:6 мл  

Указанные на сайте цены включают НДС. Цена указана со склада в Москве

Назад к странице «Наборы и реактивы для проведения амплификации и ПЦР»